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纯化蛋白有效的就是亲和层析，它是通过目的蛋白与相匹配的固定化配体的进行特异性结合，实现纯化目的。显着的特点就是，良好表征的标签与其对应的固相偶联的配体的结合，能够对标记蛋白单步操作实现亲和纯化。融合标签的抗体也被广泛用于下游检测和实验，从而无需针对每种特定重组蛋白去开发相应的探针。
抗体纯化主要涉及从血清（多克隆抗体）、腹水和杂交瘤细胞系培养上清液（单克隆抗体）中选择性富集或特异性分离抗体。Protein A，Protein G和Protein L是三种细菌蛋白，因其与抗体的高效结合而被大家所熟知。这些蛋白经过基因工程编辑重组表达，通常用于从各种不同物种中进行关键抗体类型的亲和纯化。
对于分析蛋白质个体和蛋白质复合物，鉴定蛋白质与蛋白质、核酸之间的相互作用，蛋白质的纯化是这些研究的基石。由于纯化天然蛋白是一件J具挑战性的工作，科学家开发出来利用标签融合蛋白来捕获纯化和检测目的蛋白的实验体系。
蛋白纯化填料
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